Ο Ηλίας Αμπατζίδης γεννήθηκε στις 2 Μαρτίου του 1981. Είναι απόφοιτος του Αριστοτέλειου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης, με εξειδίκευση στο ποδόσφαιρο και έχει δίπλωμα προπονητή UEFA B, καθώς και Bachelor.

Η καριέρα του άρχισε στην ακαδημία του ΠΑΟΚ, για να περάσει στην συνέχεια από Πιερικό, Καλλονή, Ηρακλή, Ξάνθη, ακαδημία Ολυμπιακού, Βέροια, Ομόνοια Κύπρου, ακαδημία ΑΕΚ και ξανά Ηρακλή. Στον Παναθηναϊκό εντάχθηκε τη σεζόν 2018-19, μέσω της ακαδημίας.