Ο Παναθηναϊκός πήρε τους τρεις βαθμούς της νίκης κόντρα στον Λεβαδειακό με 2-0 στα πλαίσια της 5ης αγωνιστικής του πρωταθλήματος. Τα γκολ του Παναθηναϊκού πέτυχαν ο Άντε Ρουκάβινα στο 25΄ και ο Δημήτρης Σαλπιγγίδης στο τελευταίο λεπτό του πρώτο ημιχρόνου.
05/10/2008 Ο Παναθηναϊκός έφυγε νικητής από το Κλεάνθης Βικελίδης καθώς νίκησε τον Άρη με 2-1 πετυχαίνοντας την δεύτερη νίκη του στο πρωτάθλημα. Οι "πράσινοι" αν και βρέθηκαν νωρίς πίσω στο σκορ κατόρθωσαν να γυρίσουν το παιχνίδι μέσα σε επτά λεπτά με γκολ των Κλέιτον και Ίβανσιτς. Στην συνέχεια του αγώνα οι "πράσινοι" είχαν ευκαιρίες ώστε να "κλειδώσουν" τους τρείς βαθμούς της νίκης, αλλά τελικά το σφύριγμα της λήξης τους βρήκε νικητές.
20/09/2008 
Το τελευταίο σφύριγμα της λήξης στο ΑΧΑ Αrena της Πράγας, βρήκε νικητή τον Παναθηναϊκό με 2-1 επί της Σπάρτα για το πρώτο παιχνίδι της 3ης προκριματικής φάσης του Τσάμπιονς Λιγκ. Οι "πράσινοι" έκαναν απόψε ένα σημαντικό βήμα για την πρόκριση στους ομίλους της διοργάνωσης και πλέον έχουν το πάνω χέρι στη ρεβάνς της Αθήνας στις 26 Αυγούστου.
14/08/2008 Η ΠΑΕ Παναθηναϊκός ανακοινώνει την απόκτηση του ποδοσφαιριστή Gilberto Aparecido da Silva,
17/07/2008 Η ΠΑΕ Παναθηναϊκός ανακοινώνει την απόκτηση του ποδοσφαιριστή ¨Αντε Ρουκάβινα
07/07/2008